شغلت الدكتورة بدر الدين العديد من المناصب الطبية والإدارية. كانت استشارية في الطب الباطني والأمراض المعدية في لبنان، مديرة طبية في مستشفى النبطية، لبنان، قائدة فريق برنامج الجودة في منطقة مكة المكرمة، مديرة الأمراض المعدية في مستشفى الملك فيصل التخصصي ومركز الأبحاث.
رئيسة قسم الأمراض المعدية واستشارية لدى CMCO، مستشفى الملك فهد التخصصي
حصلت الدكتورة بدر الدين على العديد من الشهادات وعضوية في لجان أخرى